Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK2BP67870 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK2BP67870 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK2BP67870 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK2BP67870 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK2BP67870 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK2BP67870 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK2BP67870 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK2BP67870 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK2BP67870 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK2BP67870 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK2BP67870 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CSNK2BP67870 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSNK2BP67870 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSNK2BP67870 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CSNK2BP67870 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSNK2BP67870 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSNK2BP67870 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSNK2BP67870 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CSNK2BP67870 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CSNK2BP67870 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSNK2BP67870 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSNK2BP67870 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK2BP67870 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms