Protein–RNA interactions for Protein: P63027

VAMP2, Vesicle-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP2P63027 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAMP2P63027 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VAMP2P63027 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
VAMP2P63027 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
VAMP2P63027 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VAMP2P63027 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAMP2P63027 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
VAMP2P63027 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAMP2P63027 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAMP2P63027 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAMP2P63027 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAMP2P63027 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAMP2P63027 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAMP2P63027 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAMP2P63027 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAMP2P63027 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
VAMP2P63027 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAMP2P63027 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAMP2P63027 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAMP2P63027 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAMP2P63027 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAMP2P63027 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAMP2P63027 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VAMP2P63027 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAMP2P63027 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAMP2P63027 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAMP2P63027 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAMP2P63027 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAMP2P63027 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAMP2P63027 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAMP2P63027 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAMP2P63027 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAMP2P63027 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAMP2P63027 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms