Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RPS28P62857 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RPS28P62857 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RPS28P62857 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RPS28P62857 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RPS28P62857 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RPS28P62857 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RPS28P62857 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RPS28P62857 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RPS28P62857 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RPS28P62857 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPS28P62857 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPS28P62857 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPS28P62857 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPS28P62857 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPS28P62857 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPS28P62857 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPS28P62857 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPS28P62857 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPS28P62857 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPS28P62857 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPS28P62857 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPS28P62857 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPS28P62857 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPS28P62857 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RPS28P62857 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RPS28P62857 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPS28P62857 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPS28P62857 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPS28P62857 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPS28P62857 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPS28P62857 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPS28P62857 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPS28P62857 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPS28P62857 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPS28P62857 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPS28P62857 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPS28P62857 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPS28P62857 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPS28P62857 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPS28P62857 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPS28P62857 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS28P62857 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS28P62857 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS28P62857 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS28P62857 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS28P62857 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS28P62857 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS28P62857 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS28P62857 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS28P62857 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS28P62857 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS28P62857 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS28P62857 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS28P62857 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS28P62857 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS28P62857 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS28P62857 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS28P62857 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS28P62857 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS28P62857 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS28P62857 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS28P62857 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS28P62857 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS28P62857 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS28P62857 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS28P62857 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS28P62857 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS28P62857 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS28P62857 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS28P62857 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS28P62857 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS28P62857 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS28P62857 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS28P62857 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS28P62857 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS28P62857 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS28P62857 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS28P62857 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS28P62857 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS28P62857 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS28P62857 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS28P62857 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS28P62857 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS28P62857 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS28P62857 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS28P62857 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS28P62857 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS28P62857 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS28P62857 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS28P62857 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS28P62857 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS28P62857 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS28P62857 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS28P62857 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS28P62857 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS28P62857 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS28P62857 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS28P62857 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS28P62857 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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