Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.2 ms