Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2NP61088 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2NP61088 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2NP61088 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2NP61088 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBE2NP61088 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE2NP61088 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE2NP61088 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE2NP61088 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE2NP61088 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE2NP61088 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE2NP61088 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE2NP61088 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2NP61088 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2NP61088 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2NP61088 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2NP61088 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2NP61088 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2NP61088 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2NP61088 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2NP61088 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2NP61088 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE2NP61088 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE2NP61088 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE2NP61088 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE2NP61088 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE2NP61088 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms