Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNAP25P60880 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNAP25P60880 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms