Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EEFSECP57772 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms