Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTSWP56202 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTSWP56202 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTSWP56202 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTSWP56202 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTSWP56202 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTSWP56202 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTSWP56202 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTSWP56202 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTSWP56202 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTSWP56202 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CTSWP56202 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTSWP56202 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTSWP56202 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTSWP56202 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTSWP56202 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTSWP56202 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTSWP56202 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTSWP56202 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTSWP56202 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTSWP56202 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTSWP56202 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTSWP56202 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTSWP56202 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTSWP56202 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CTSWP56202 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTSWP56202 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTSWP56202 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTSWP56202 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTSWP56202 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTSWP56202 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTSWP56202 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTSWP56202 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTSWP56202 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTSWP56202 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTSWP56202 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTSWP56202 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTSWP56202 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTSWP56202 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTSWP56202 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTSWP56202 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTSWP56202 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTSWP56202 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTSWP56202 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTSWP56202 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTSWP56202 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTSWP56202 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTSWP56202 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTSWP56202 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTSWP56202 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CTSWP56202 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTSWP56202 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CTSWP56202 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTSWP56202 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTSWP56202 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTSWP56202 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTSWP56202 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTSWP56202 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTSWP56202 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTSWP56202 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTSWP56202 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CTSWP56202 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTSWP56202 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTSWP56202 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTSWP56202 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTSWP56202 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTSWP56202 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTSWP56202 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTSWP56202 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTSWP56202 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CTSWP56202 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTSWP56202 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CTSWP56202 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTSWP56202 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTSWP56202 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTSWP56202 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTSWP56202 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTSWP56202 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTSWP56202 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTSWP56202 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTSWP56202 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTSWP56202 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTSWP56202 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTSWP56202 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTSWP56202 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTSWP56202 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTSWP56202 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTSWP56202 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTSWP56202 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTSWP56202 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CTSWP56202 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTSWP56202 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTSWP56202 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTSWP56202 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CTSWP56202 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTSWP56202 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTSWP56202 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTSWP56202 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTSWP56202 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTSWP56202 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms