Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OXCT1P55809 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms