Protein–RNA interactions for Protein: P55789

GFER, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFERP55789 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFERP55789 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFERP55789 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFERP55789 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFERP55789 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFERP55789 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GFERP55789 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFERP55789 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFERP55789 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFERP55789 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFERP55789 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFERP55789 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFERP55789 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFERP55789 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFERP55789 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFERP55789 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFERP55789 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFERP55789 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFERP55789 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFERP55789 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFERP55789 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFERP55789 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFERP55789 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFERP55789 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFERP55789 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GFERP55789 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GFERP55789 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GFERP55789 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFERP55789 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFERP55789 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFERP55789 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GFERP55789 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFERP55789 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFERP55789 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFERP55789 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFERP55789 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GFERP55789 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GFERP55789 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GFERP55789 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GFERP55789 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GFERP55789 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFERP55789 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFERP55789 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFERP55789 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFERP55789 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFERP55789 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFERP55789 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFERP55789 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFERP55789 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFERP55789 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFERP55789 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFERP55789 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFERP55789 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFERP55789 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFERP55789 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFERP55789 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GFERP55789 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFERP55789 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFERP55789 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFERP55789 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GFERP55789 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFERP55789 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFERP55789 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFERP55789 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFERP55789 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFERP55789 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GFERP55789 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFERP55789 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFERP55789 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GFERP55789 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GFERP55789 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GFERP55789 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFERP55789 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFERP55789 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFERP55789 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFERP55789 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFERP55789 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFERP55789 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFERP55789 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFERP55789 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFERP55789 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFERP55789 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFERP55789 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFERP55789 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFERP55789 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFERP55789 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFERP55789 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFERP55789 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFERP55789 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFERP55789 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFERP55789 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFERP55789 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFERP55789 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFERP55789 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GFERP55789 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFERP55789 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFERP55789 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFERP55789 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFERP55789 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFERP55789 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms