Protein–RNA interactions for Protein: P55055

NR1H2, Oxysterols receptor LXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H2P55055 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1H2P55055 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NR1H2P55055 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NR1H2P55055 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1H2P55055 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1H2P55055 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1H2P55055 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1H2P55055 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1H2P55055 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1H2P55055 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1H2P55055 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1H2P55055 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1H2P55055 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms