Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHA4P54764 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA4P54764 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms