Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD23BP54727 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD23BP54727 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms