Protein–RNA interactions for Protein: P53634

CTSC, Dipeptidyl peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSCP53634 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSCP53634 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSCP53634 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSCP53634 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSCP53634 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSCP53634 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSCP53634 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSCP53634 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSCP53634 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSCP53634 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSCP53634 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSCP53634 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSCP53634 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSCP53634 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSCP53634 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSCP53634 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSCP53634 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSCP53634 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSCP53634 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSCP53634 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSCP53634 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSCP53634 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSCP53634 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSCP53634 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSCP53634 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSCP53634 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSCP53634 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSCP53634 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSCP53634 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSCP53634 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTSCP53634 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTSCP53634 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTSCP53634 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CTSCP53634 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTSCP53634 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSCP53634 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSCP53634 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSCP53634 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSCP53634 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSCP53634 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSCP53634 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSCP53634 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSCP53634 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSCP53634 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSCP53634 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSCP53634 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSCP53634 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSCP53634 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSCP53634 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSCP53634 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSCP53634 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSCP53634 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSCP53634 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSCP53634 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSCP53634 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSCP53634 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSCP53634 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSCP53634 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSCP53634 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSCP53634 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSCP53634 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSCP53634 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSCP53634 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSCP53634 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSCP53634 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSCP53634 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSCP53634 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSCP53634 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CTSCP53634 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSCP53634 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSCP53634 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSCP53634 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSCP53634 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSCP53634 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSCP53634 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSCP53634 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSCP53634 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSCP53634 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSCP53634 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSCP53634 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSCP53634 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSCP53634 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSCP53634 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSCP53634 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSCP53634 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSCP53634 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSCP53634 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSCP53634 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSCP53634 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSCP53634 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSCP53634 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSCP53634 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSCP53634 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSCP53634 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSCP53634 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSCP53634 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSCP53634 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSCP53634 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSCP53634 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSCP53634 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms