Protein–RNA interactions for Protein: P53384

NUBP1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP1P53384 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUBP1P53384 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms