Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARFIP2P53365 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms