Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUP98P52948 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUP98P52948 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUP98P52948 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUP98P52948 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUP98P52948 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUP98P52948 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUP98P52948 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUP98P52948 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUP98P52948 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUP98P52948 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUP98P52948 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUP98P52948 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUP98P52948 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NUP98P52948 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NUP98P52948 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NUP98P52948 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NUP98P52948 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUP98P52948 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUP98P52948 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NUP98P52948 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUP98P52948 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUP98P52948 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUP98P52948 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUP98P52948 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUP98P52948 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUP98P52948 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUP98P52948 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NUP98P52948 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUP98P52948 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUP98P52948 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NUP98P52948 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUP98P52948 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP98P52948 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP98P52948 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP98P52948 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP98P52948 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP98P52948 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP98P52948 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP98P52948 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP98P52948 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP98P52948 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUP98P52948 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUP98P52948 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUP98P52948 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUP98P52948 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUP98P52948 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUP98P52948 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUP98P52948 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUP98P52948 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUP98P52948 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUP98P52948 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUP98P52948 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUP98P52948 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NUP98P52948 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUP98P52948 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUP98P52948 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP98P52948 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP98P52948 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP98P52948 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP98P52948 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP98P52948 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP98P52948 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP98P52948 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP98P52948 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP98P52948 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP98P52948 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP98P52948 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP98P52948 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP98P52948 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP98P52948 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP98P52948 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP98P52948 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP98P52948 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP98P52948 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP98P52948 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP98P52948 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP98P52948 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP98P52948 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUP98P52948 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NUP98P52948 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NUP98P52948 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NUP98P52948 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NUP98P52948 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NUP98P52948 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
NUP98P52948 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUP98P52948 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUP98P52948 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUP98P52948 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP98P52948 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP98P52948 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP98P52948 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP98P52948 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP98P52948 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP98P52948 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP98P52948 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP98P52948 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP98P52948 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP98P52948 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP98P52948 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms