Protein–RNA interactions for Protein: P51809

VAMP7, Vesicle-associated membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP7P51809 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAMP7P51809 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms