Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAPOLAP51003 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAPOLAP51003 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAPOLAP51003 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAPOLAP51003 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAPOLAP51003 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAPOLAP51003 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAPOLAP51003 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAPOLAP51003 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAPOLAP51003 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAPOLAP51003 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAPOLAP51003 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PAPOLAP51003 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAPOLAP51003 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAPOLAP51003 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PAPOLAP51003 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PAPOLAP51003 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAPOLAP51003 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PAPOLAP51003 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAPOLAP51003 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAPOLAP51003 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PAPOLAP51003 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAPOLAP51003 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms