Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GATMP50440 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GATMP50440 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GATMP50440 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GATMP50440 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GATMP50440 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GATMP50440 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GATMP50440 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GATMP50440 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GATMP50440 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GATMP50440 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GATMP50440 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GATMP50440 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GATMP50440 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GATMP50440 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GATMP50440 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GATMP50440 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GATMP50440 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GATMP50440 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GATMP50440 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GATMP50440 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GATMP50440 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GATMP50440 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GATMP50440 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GATMP50440 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GATMP50440 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GATMP50440 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GATMP50440 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GATMP50440 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GATMP50440 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GATMP50440 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GATMP50440 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GATMP50440 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GATMP50440 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GATMP50440 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GATMP50440 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GATMP50440 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GATMP50440 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GATMP50440 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GATMP50440 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GATMP50440 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GATMP50440 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GATMP50440 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GATMP50440 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GATMP50440 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GATMP50440 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GATMP50440 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GATMP50440 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GATMP50440 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GATMP50440 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GATMP50440 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GATMP50440 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GATMP50440 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GATMP50440 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GATMP50440 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GATMP50440 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GATMP50440 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GATMP50440 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GATMP50440 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GATMP50440 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GATMP50440 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GATMP50440 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GATMP50440 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GATMP50440 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GATMP50440 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GATMP50440 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GATMP50440 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GATMP50440 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GATMP50440 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GATMP50440 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GATMP50440 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GATMP50440 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GATMP50440 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GATMP50440 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GATMP50440 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GATMP50440 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GATMP50440 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GATMP50440 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GATMP50440 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GATMP50440 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GATMP50440 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GATMP50440 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GATMP50440 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GATMP50440 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GATMP50440 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GATMP50440 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GATMP50440 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GATMP50440 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GATMP50440 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GATMP50440 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GATMP50440 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GATMP50440 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GATMP50440 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GATMP50440 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GATMP50440 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GATMP50440 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GATMP50440 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GATMP50440 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GATMP50440 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GATMP50440 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms