Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSEN2P49810 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSEN2P49810 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms