Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP4P49662 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP4P49662 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP4P49662 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP4P49662 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP4P49662 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP4P49662 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP4P49662 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP4P49662 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP4P49662 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP4P49662 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP4P49662 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP4P49662 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP4P49662 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP4P49662 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP4P49662 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP4P49662 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP4P49662 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP4P49662 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP4P49662 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP4P49662 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP4P49662 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP4P49662 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP4P49662 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP4P49662 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP4P49662 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP4P49662 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP4P49662 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP4P49662 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP4P49662 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP4P49662 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP4P49662 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP4P49662 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP4P49662 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP4P49662 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP4P49662 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP4P49662 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP4P49662 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP4P49662 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP4P49662 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CASP4P49662 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP4P49662 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP4P49662 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP4P49662 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP4P49662 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP4P49662 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP4P49662 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP4P49662 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP4P49662 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP4P49662 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP4P49662 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP4P49662 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP4P49662 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP4P49662 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP4P49662 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP4P49662 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP4P49662 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP4P49662 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP4P49662 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP4P49662 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP4P49662 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP4P49662 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP4P49662 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP4P49662 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP4P49662 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP4P49662 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP4P49662 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP4P49662 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP4P49662 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP4P49662 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP4P49662 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP4P49662 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP4P49662 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP4P49662 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP4P49662 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP4P49662 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP4P49662 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP4P49662 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP4P49662 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP4P49662 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP4P49662 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP4P49662 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CASP4P49662 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CASP4P49662 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP4P49662 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP4P49662 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP4P49662 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP4P49662 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP4P49662 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP4P49662 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP4P49662 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP4P49662 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP4P49662 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP4P49662 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP4P49662 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP4P49662 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP4P49662 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP4P49662 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP4P49662 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP4P49662 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms