Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNJ1P48048 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms