Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRXP46100 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRXP46100 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRXP46100 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRXP46100 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRXP46100 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRXP46100 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRXP46100 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRXP46100 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRXP46100 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRXP46100 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRXP46100 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRXP46100 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRXP46100 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRXP46100 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRXP46100 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRXP46100 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRXP46100 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRXP46100 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRXP46100 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRXP46100 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRXP46100 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRXP46100 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRXP46100 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRXP46100 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRXP46100 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRXP46100 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRXP46100 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRXP46100 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRXP46100 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRXP46100 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRXP46100 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATRXP46100 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATRXP46100 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATRXP46100 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATRXP46100 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATRXP46100 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATRXP46100 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATRXP46100 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATRXP46100 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATRXP46100 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATRXP46100 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATRXP46100 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATRXP46100 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATRXP46100 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATRXP46100 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATRXP46100 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATRXP46100 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATRXP46100 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATRXP46100 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATRXP46100 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATRXP46100 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATRXP46100 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATRXP46100 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATRXP46100 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATRXP46100 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATRXP46100 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATRXP46100 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATRXP46100 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATRXP46100 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATRXP46100 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATRXP46100 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATRXP46100 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATRXP46100 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATRXP46100 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATRXP46100 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATRXP46100 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATRXP46100 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRXP46100 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRXP46100 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRXP46100 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRXP46100 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRXP46100 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRXP46100 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRXP46100 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRXP46100 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRXP46100 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATRXP46100 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATRXP46100 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATRXP46100 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATRXP46100 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATRXP46100 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATRXP46100 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATRXP46100 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATRXP46100 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATRXP46100 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATRXP46100 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATRXP46100 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATRXP46100 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATRXP46100 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATRXP46100 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATRXP46100 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATRXP46100 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATRXP46100 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATRXP46100 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATRXP46100 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRXP46100 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRXP46100 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRXP46100 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRXP46100 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms