Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKX2-1P43699 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKX2-1P43699 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKX2-1P43699 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKX2-1P43699 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKX2-1P43699 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKX2-1P43699 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKX2-1P43699 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKX2-1P43699 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX2-1P43699 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms