Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA3P43357 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAGEA3P43357 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAGEA3P43357 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MAGEA3P43357 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAGEA3P43357 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAGEA3P43357 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAGEA3P43357 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAGEA3P43357 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAGEA3P43357 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAGEA3P43357 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAGEA3P43357 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAGEA3P43357 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAGEA3P43357 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAGEA3P43357 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAGEA3P43357 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAGEA3P43357 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAGEA3P43357 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAGEA3P43357 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAGEA3P43357 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAGEA3P43357 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAGEA3P43357 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAGEA3P43357 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAGEA3P43357 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAGEA3P43357 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAGEA3P43357 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAGEA3P43357 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms