Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCAMP43121 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCAMP43121 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCAMP43121 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCAMP43121 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCAMP43121 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCAMP43121 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCAMP43121 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCAMP43121 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCAMP43121 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCAMP43121 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCAMP43121 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCAMP43121 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCAMP43121 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCAMP43121 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MCAMP43121 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MCAMP43121 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCAMP43121 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCAMP43121 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCAMP43121 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCAMP43121 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCAMP43121 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCAMP43121 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCAMP43121 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCAMP43121 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCAMP43121 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
MCAMP43121 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCAMP43121 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MCAMP43121 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MCAMP43121 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MCAMP43121 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MCAMP43121 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCAMP43121 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCAMP43121 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCAMP43121 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCAMP43121 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCAMP43121 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MCAMP43121 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCAMP43121 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCAMP43121 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCAMP43121 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCAMP43121 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCAMP43121 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCAMP43121 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCAMP43121 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCAMP43121 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCAMP43121 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCAMP43121 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCAMP43121 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCAMP43121 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCAMP43121 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCAMP43121 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCAMP43121 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCAMP43121 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCAMP43121 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCAMP43121 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCAMP43121 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MCAMP43121 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCAMP43121 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCAMP43121 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCAMP43121 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCAMP43121 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCAMP43121 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCAMP43121 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCAMP43121 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCAMP43121 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCAMP43121 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCAMP43121 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCAMP43121 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCAMP43121 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCAMP43121 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCAMP43121 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MCAMP43121 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCAMP43121 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCAMP43121 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCAMP43121 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCAMP43121 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCAMP43121 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCAMP43121 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCAMP43121 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCAMP43121 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCAMP43121 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MCAMP43121 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCAMP43121 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCAMP43121 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCAMP43121 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCAMP43121 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCAMP43121 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCAMP43121 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCAMP43121 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCAMP43121 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCAMP43121 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCAMP43121 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCAMP43121 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCAMP43121 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCAMP43121 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCAMP43121 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCAMP43121 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCAMP43121 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCAMP43121 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms