Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC19A1P41440 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms