Protein–RNA interactions for Protein: P41162

ETV3, ETS translocation variant 3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV3P41162 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ETV3P41162 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ETV3P41162 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ETV3P41162 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ETV3P41162 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ETV3P41162 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ETV3P41162 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ETV3P41162 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ETV3P41162 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ETV3P41162 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ETV3P41162 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ETV3P41162 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ETV3P41162 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ETV3P41162 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ETV3P41162 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ETV3P41162 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ETV3P41162 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ETV3P41162 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ETV3P41162 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ETV3P41162 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ETV3P41162 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ETV3P41162 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ETV3P41162 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ETV3P41162 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ETV3P41162 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ETV3P41162 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ETV3P41162 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ETV3P41162 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ETV3P41162 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ETV3P41162 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ETV3P41162 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ETV3P41162 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ETV3P41162 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ETV3P41162 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ETV3P41162 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ETV3P41162 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ETV3P41162 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ETV3P41162 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ETV3P41162 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ETV3P41162 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ETV3P41162 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ETV3P41162 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ETV3P41162 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ETV3P41162 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ETV3P41162 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ETV3P41162 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ETV3P41162 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ETV3P41162 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ETV3P41162 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ETV3P41162 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ETV3P41162 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ETV3P41162 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ETV3P41162 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ETV3P41162 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ETV3P41162 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ETV3P41162 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ETV3P41162 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ETV3P41162 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ETV3P41162 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ETV3P41162 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ETV3P41162 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ETV3P41162 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ETV3P41162 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ETV3P41162 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ETV3P41162 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ETV3P41162 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ETV3P41162 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ETV3P41162 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ETV3P41162 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ETV3P41162 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ETV3P41162 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ETV3P41162 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ETV3P41162 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ETV3P41162 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ETV3P41162 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ETV3P41162 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ETV3P41162 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ETV3P41162 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ETV3P41162 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ETV3P41162 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETV3P41162 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETV3P41162 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETV3P41162 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETV3P41162 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETV3P41162 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETV3P41162 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETV3P41162 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ETV3P41162 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ETV3P41162 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ETV3P41162 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ETV3P41162 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ETV3P41162 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ETV3P41162 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ETV3P41162 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ETV3P41162 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ETV3P41162 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ETV3P41162 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ETV3P41162 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ETV3P41162 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ETV3P41162 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms