Protein–RNA interactions for Protein: P40501

AVT7, Vacuolar amino acid transporter 7, yeastyeast

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT7P40501 AIM17YHL021C 1398 nt4.79□□□□□ -1.64
AVT7P40501 ATG23YLR431C 1362 nt4.79□□□□□ -1.64
AVT7P40501 ECM3YOR092W 1842 nt4.79□□□□□ -1.64
AVT7P40501 SOH1YGL127C 384 nt4.79□□□□□ -1.64
AVT7P40501 HSX1tR(CCU)J 72 nt4.79□□□□□ -1.64
AVT7P40501 TFS1YLR178C 660 nt4.79□□□□□ -1.64
AVT7P40501 VMS1YDR049W 1899 nt4.79□□□□□ -1.64
AVT7P40501 RTT106YNL206C 1368 nt4.78□□□□□ -1.64
AVT7P40501 SOG2YOR353C 2376 nt4.78□□□□□ -1.64
AVT7P40501 ACF2YLR144C 2340 nt4.78□□□□□ -1.64
AVT7P40501 TEA1YOR337W 2280 nt4.78□□□□□ -1.64
AVT7P40501 DPB2YPR175W 2070 nt4.78□□□□□ -1.64
AVT7P40501 YDR541CYDR541C 1035 nt4.78□□□□□ -1.64
AVT7P40501 YMR155WYMR155W 1644 nt4.78□□□□□ -1.64
AVT7P40501 RRN3YKL125W 1884 nt4.77□□□□□ -1.65
AVT7P40501 KNH1YDL049C 807 nt4.77□□□□□ -1.65
AVT7P40501 COX26YDR119W-A 201 nt4.77□□□□□ -1.65
AVT7P40501 VMA16YHR026W 642 nt4.77□□□□□ -1.65
AVT7P40501 VPS1YKR001C 2115 nt4.77□□□□□ -1.65
AVT7P40501 OCA5YHL029C 2040 nt4.77□□□□□ -1.65
AVT7P40501 RPT2YDL007W 1314 nt4.76□□□□□ -1.65
AVT7P40501 HRP1YOL123W 1605 nt4.76□□□□□ -1.65
AVT7P40501 GCS1YDL226C 1059 nt4.76□□□□□ -1.65
AVT7P40501 CAD1YDR423C 1230 nt4.76□□□□□ -1.65
AVT7P40501 REV7YIL139C 738 nt4.76□□□□□ -1.65
AVT7P40501 YJR115WYJR115W 510 nt4.76□□□□□ -1.65
AVT7P40501 MRPL13YKR006C 795 nt4.76□□□□□ -1.65
AVT7P40501 YLL059CYLL059C 507 nt4.76□□□□□ -1.65
AVT7P40501 YLR118CYLR118C 684 nt4.76□□□□□ -1.65
AVT7P40501 MRPL15YLR312W-A 762 nt4.76□□□□□ -1.65
AVT7P40501 PGA3YML125C 939 nt4.76□□□□□ -1.65
AVT7P40501 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt4.76□□□□□ -1.65
AVT7P40501 BPL1YDL141W 2073 nt4.76□□□□□ -1.65
AVT7P40501 NRD1YNL251C 1728 nt4.75□□□□□ -1.65
AVT7P40501 TIM54YJL054W 1437 nt4.75□□□□□ -1.65
AVT7P40501 ADE13YLR359W 1449 nt4.75□□□□□ -1.65
AVT7P40501 YGR182CYGR182C 354 nt4.75□□□□□ -1.65
AVT7P40501 YHR145CYHR145C 357 nt4.75□□□□□ -1.65
AVT7P40501 MND2YIR025W 1107 nt4.75□□□□□ -1.65
AVT7P40501 PHO86YJL117W 936 nt4.75□□□□□ -1.65
AVT7P40501 YJU2YKL095W 837 nt4.75□□□□□ -1.65
AVT7P40501 YLR194CYLR194C 765 nt4.75□□□□□ -1.65
AVT7P40501 HSP26YBR072W 645 nt4.75□□□□□ -1.65
AVT7P40501 SUE1YPR151C 621 nt4.75□□□□□ -1.65
AVT7P40501 YPR195CYPR195C 330 nt4.75□□□□□ -1.65
AVT7P40501 VHS1YDR247W 1386 nt4.75□□□□□ -1.65
AVT7P40501 AVO1YOL078W 3531 nt4.75□□□□□ -1.65
AVT7P40501 BRF1YGR246C 1791 nt4.74□□□□□ -1.65
AVT7P40501 YKL151CYKL151C 1014 nt4.74□□□□□ -1.65
AVT7P40501 PNP1YLR209C 936 nt4.74□□□□□ -1.65
AVT7P40501 CAM1YPL048W 1248 nt4.74□□□□□ -1.65
AVT7P40501 UBC4YBR082C 447 nt4.74□□□□□ -1.65
AVT7P40501 GLT1YDL171C 6438 nt4.74□□□□□ -1.65
AVT7P40501 DBF4YDR052C 2115 nt4.73□□□□□ -1.65
AVT7P40501 AAP1YHR047C 2571 nt4.73□□□□□ -1.65
AVT7P40501 DPH2YKL191W 1605 nt4.73□□□□□ -1.65
AVT7P40501 ERG7YHR072W 2196 nt4.73□□□□□ -1.65
AVT7P40501 SHE10YGL228W 1734 nt4.73□□□□□ -1.65
AVT7P40501 RML2YEL050C 1182 nt4.73□□□□□ -1.65
AVT7P40501 GAT4YIR013C 366 nt4.73□□□□□ -1.65
AVT7P40501 YJL171CYJL171C 1191 nt4.73□□□□□ -1.65
AVT7P40501 MTW1YAL034W-A 870 nt4.73□□□□□ -1.65
AVT7P40501 YNR048WYNR048W 1182 nt4.73□□□□□ -1.65
AVT7P40501 PZF1YPR186C 1290 nt4.73□□□□□ -1.65
AVT7P40501 snR32snR32 188 nt4.73□□□□□ -1.65
AVT7P40501 NOP7YGR103W 1818 nt4.73□□□□□ -1.65
AVT7P40501 GUP2YPL189W 1830 nt4.73□□□□□ -1.65
AVT7P40501 VID30YGL227W 2877 nt4.73□□□□□ -1.65
AVT7P40501 DED81YHR019C 1665 nt4.73□□□□□ -1.65
AVT7P40501 ATE1YGL017W 1512 nt4.72□□□□□ -1.65
AVT7P40501 YJR015WYJR015W 1533 nt4.72□□□□□ -1.65
AVT7P40501 UTP9YHR196W 1728 nt4.72□□□□□ -1.65
AVT7P40501 SSY5YJL156C 2100 nt4.72□□□□□ -1.65
AVT7P40501 FRE3YOR381W 2136 nt4.72□□□□□ -1.65
AVT7P40501 RIM15YFL033C 5313 nt4.72□□□□□ -1.65
AVT7P40501 RAT1YOR048C 3021 nt4.72□□□□□ -1.65
AVT7P40501 YDL034WYDL034W 345 nt4.72□□□□□ -1.65
AVT7P40501 MRF1YGL143C 1242 nt4.72□□□□□ -1.65
AVT7P40501 LDB18YLL049W 540 nt4.72□□□□□ -1.65
AVT7P40501 SWP1YMR149W 861 nt4.72□□□□□ -1.65
AVT7P40501 GEP3YOR205C 1671 nt4.71□□□□□ -1.66
AVT7P40501 YKR073CYKR073C 321 nt4.71□□□□□ -1.66
AVT7P40501 SEC13YLR208W 894 nt4.71□□□□□ -1.66
AVT7P40501 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt4.71□□□□□ -1.66
AVT7P40501 CBC2YPL178W 627 nt4.71□□□□□ -1.66
AVT7P40501 STE50YCL032W 1041 nt4.71□□□□□ -1.66
AVT7P40501 ECM7YLR443W 1347 nt4.71□□□□□ -1.66
AVT7P40501 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt4.7□□□□□ -1.66
AVT7P40501 LCP5YER127W 1074 nt4.7□□□□□ -1.66
AVT7P40501 SLO1YER180C-A 258 nt4.7□□□□□ -1.66
AVT7P40501 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt4.7□□□□□ -1.66
AVT7P40501 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt4.7□□□□□ -1.66
AVT7P40501 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt4.7□□□□□ -1.66
AVT7P40501 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt4.7□□□□□ -1.66
AVT7P40501 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt4.7□□□□□ -1.66
AVT7P40501 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt4.7□□□□□ -1.66
AVT7P40501 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt4.7□□□□□ -1.66
AVT7P40501 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt4.7□□□□□ -1.66
AVT7P40501 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt4.7□□□□□ -1.66
AVT7P40501 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.4 ms