Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PBX1P40424 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PBX1P40424 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PBX1P40424 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBX1P40424 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBX1P40424 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBX1P40424 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PBX1P40424 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBX1P40424 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBX1P40424 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBX1P40424 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBX1P40424 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PBX1P40424 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PBX1P40424 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PBX1P40424 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PBX1P40424 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PBX1P40424 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PBX1P40424 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PBX1P40424 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PBX1P40424 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PBX1P40424 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PBX1P40424 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PBX1P40424 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PBX1P40424 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PBX1P40424 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PBX1P40424 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PBX1P40424 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PBX1P40424 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PBX1P40424 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PBX1P40424 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PBX1P40424 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PBX1P40424 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PBX1P40424 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PBX1P40424 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PBX1P40424 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PBX1P40424 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PBX1P40424 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PBX1P40424 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PBX1P40424 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PBX1P40424 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PBX1P40424 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PBX1P40424 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PBX1P40424 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PBX1P40424 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PBX1P40424 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PBX1P40424 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PBX1P40424 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PBX1P40424 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PBX1P40424 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PBX1P40424 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PBX1P40424 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PBX1P40424 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PBX1P40424 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PBX1P40424 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBX1P40424 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBX1P40424 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBX1P40424 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBX1P40424 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBX1P40424 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBX1P40424 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBX1P40424 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBX1P40424 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBX1P40424 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBX1P40424 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBX1P40424 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBX1P40424 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBX1P40424 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBX1P40424 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBX1P40424 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBX1P40424 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBX1P40424 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBX1P40424 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBX1P40424 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBX1P40424 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBX1P40424 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBX1P40424 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PBX1P40424 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBX1P40424 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBX1P40424 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBX1P40424 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBX1P40424 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBX1P40424 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBX1P40424 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PBX1P40424 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PBX1P40424 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBX1P40424 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBX1P40424 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBX1P40424 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBX1P40424 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBX1P40424 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBX1P40424 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBX1P40424 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBX1P40424 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBX1P40424 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBX1P40424 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBX1P40424 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBX1P40424 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PBX1P40424 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBX1P40424 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBX1P40424 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms