Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBRP36941 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBRP36941 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBRP36941 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBRP36941 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBRP36941 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBRP36941 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBRP36941 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBRP36941 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBRP36941 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBRP36941 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBRP36941 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBRP36941 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBRP36941 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LTBRP36941 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LTBRP36941 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LTBRP36941 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LTBRP36941 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LTBRP36941 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBRP36941 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBRP36941 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBRP36941 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBRP36941 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBRP36941 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBRP36941 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBRP36941 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBRP36941 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTBRP36941 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTBRP36941 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTBRP36941 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTBRP36941 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTBRP36941 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTBRP36941 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTBRP36941 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTBRP36941 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTBRP36941 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTBRP36941 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LTBRP36941 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTBRP36941 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTBRP36941 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTBRP36941 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTBRP36941 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTBRP36941 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTBRP36941 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTBRP36941 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTBRP36941 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTBRP36941 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LTBRP36941 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LTBRP36941 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTBRP36941 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTBRP36941 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTBRP36941 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTBRP36941 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTBRP36941 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTBRP36941 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTBRP36941 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTBRP36941 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTBRP36941 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LTBRP36941 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTBRP36941 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTBRP36941 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTBRP36941 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBRP36941 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBRP36941 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBRP36941 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBRP36941 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBRP36941 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBRP36941 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBRP36941 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBRP36941 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBRP36941 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBRP36941 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBRP36941 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBRP36941 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBRP36941 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBRP36941 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBRP36941 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBRP36941 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBRP36941 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBRP36941 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBRP36941 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBRP36941 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBRP36941 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBRP36941 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBRP36941 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBRP36941 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBRP36941 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBRP36941 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBRP36941 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBRP36941 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBRP36941 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBRP36941 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBRP36941 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBRP36941 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBRP36941 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBRP36941 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBRP36941 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBRP36941 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBRP36941 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBRP36941 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms