Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 REC114-201ENST00000331090 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 CCDC152-202ENST00000388827 1237 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD11P31277 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 AC055748.1-201ENST00000489836 959 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms