Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA11P31270 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA11P31270 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA11P31270 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA11P31270 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA11P31270 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA11P31270 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA11P31270 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA11P31270 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA11P31270 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA11P31270 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA11P31270 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA11P31270 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA11P31270 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA11P31270 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA11P31270 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA11P31270 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA11P31270 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA11P31270 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA11P31270 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA11P31270 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA11P31270 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA11P31270 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA11P31270 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA11P31270 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA11P31270 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA11P31270 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA11P31270 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA11P31270 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA11P31270 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA11P31270 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HOXA11P31270 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXA11P31270 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms