Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD40LGP29965 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms