Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SHC1P29353 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHC1P29353 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHC1P29353 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHC1P29353 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SHC1P29353 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHC1P29353 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHC1P29353 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SHC1P29353 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHC1P29353 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHC1P29353 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHC1P29353 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHC1P29353 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SHC1P29353 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHC1P29353 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHC1P29353 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SHC1P29353 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SHC1P29353 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SHC1P29353 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHC1P29353 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHC1P29353 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHC1P29353 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHC1P29353 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SHC1P29353 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHC1P29353 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHC1P29353 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHC1P29353 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHC1P29353 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHC1P29353 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SHC1P29353 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SHC1P29353 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SHC1P29353 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHC1P29353 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SHC1P29353 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHC1P29353 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHC1P29353 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHC1P29353 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHC1P29353 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHC1P29353 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SHC1P29353 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHC1P29353 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHC1P29353 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHC1P29353 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHC1P29353 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHC1P29353 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SHC1P29353 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHC1P29353 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SHC1P29353 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHC1P29353 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHC1P29353 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHC1P29353 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SHC1P29353 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SHC1P29353 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHC1P29353 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHC1P29353 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHC1P29353 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHC1P29353 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHC1P29353 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHC1P29353 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHC1P29353 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHC1P29353 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHC1P29353 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHC1P29353 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHC1P29353 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHC1P29353 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHC1P29353 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHC1P29353 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SHC1P29353 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHC1P29353 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHC1P29353 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHC1P29353 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHC1P29353 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHC1P29353 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHC1P29353 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHC1P29353 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHC1P29353 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHC1P29353 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHC1P29353 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHC1P29353 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHC1P29353 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHC1P29353 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHC1P29353 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHC1P29353 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHC1P29353 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHC1P29353 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHC1P29353 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHC1P29353 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHC1P29353 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHC1P29353 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHC1P29353 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHC1P29353 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHC1P29353 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHC1P29353 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHC1P29353 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHC1P29353 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHC1P29353 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHC1P29353 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHC1P29353 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHC1P29353 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHC1P29353 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms