Protein–RNA interactions for Protein: P28356

HOXD9, Homeobox protein Hox-D9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9P28356 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD9P28356 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD9P28356 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129 ms