Protein–RNA interactions for Protein: P28331

NDUFS1, NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1P28331 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFS1P28331 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDUFS1P28331 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDUFS1P28331 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDUFS1P28331 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFS1P28331 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFS1P28331 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFS1P28331 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFS1P28331 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFS1P28331 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFS1P28331 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFS1P28331 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFS1P28331 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFS1P28331 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFS1P28331 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFS1P28331 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFS1P28331 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFS1P28331 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFS1P28331 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFS1P28331 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms