Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX2P28328 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX2P28328 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX2P28328 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX2P28328 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX2P28328 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX2P28328 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX2P28328 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX2P28328 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX2P28328 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX2P28328 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX2P28328 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX2P28328 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX2P28328 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX2P28328 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX2P28328 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX2P28328 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEX2P28328 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEX2P28328 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEX2P28328 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEX2P28328 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEX2P28328 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEX2P28328 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEX2P28328 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEX2P28328 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEX2P28328 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PEX2P28328 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PEX2P28328 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PEX2P28328 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PEX2P28328 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PEX2P28328 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PEX2P28328 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PEX2P28328 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PEX2P28328 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PEX2P28328 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PEX2P28328 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PEX2P28328 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PEX2P28328 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PEX2P28328 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PEX2P28328 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PEX2P28328 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PEX2P28328 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PEX2P28328 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PEX2P28328 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PEX2P28328 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PEX2P28328 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PEX2P28328 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PEX2P28328 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PEX2P28328 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PEX2P28328 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PEX2P28328 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PEX2P28328 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PEX2P28328 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PEX2P28328 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PEX2P28328 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PEX2P28328 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PEX2P28328 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PEX2P28328 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PEX2P28328 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PEX2P28328 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PEX2P28328 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PEX2P28328 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX2P28328 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX2P28328 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX2P28328 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX2P28328 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX2P28328 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX2P28328 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX2P28328 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX2P28328 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX2P28328 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PEX2P28328 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PEX2P28328 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PEX2P28328 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PEX2P28328 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PEX2P28328 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PEX2P28328 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PEX2P28328 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PEX2P28328 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PEX2P28328 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PEX2P28328 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PEX2P28328 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PEX2P28328 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PEX2P28328 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PEX2P28328 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PEX2P28328 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PEX2P28328 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PEX2P28328 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PEX2P28328 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PEX2P28328 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PEX2P28328 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PEX2P28328 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PEX2P28328 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PEX2P28328 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PEX2P28328 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PEX2P28328 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PEX2P28328 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PEX2P28328 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PEX2P28328 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PEX2P28328 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms