Protein–RNA interactions for Protein: P26440

IVD, Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IVDP26440 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IVDP26440 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IVDP26440 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IVDP26440 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IVDP26440 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IVDP26440 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IVDP26440 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IVDP26440 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IVDP26440 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IVDP26440 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IVDP26440 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IVDP26440 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IVDP26440 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IVDP26440 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IVDP26440 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IVDP26440 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IVDP26440 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IVDP26440 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IVDP26440 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IVDP26440 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IVDP26440 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IVDP26440 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IVDP26440 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IVDP26440 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IVDP26440 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IVDP26440 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IVDP26440 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IVDP26440 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IVDP26440 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IVDP26440 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IVDP26440 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IVDP26440 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IVDP26440 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IVDP26440 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IVDP26440 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IVDP26440 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IVDP26440 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IVDP26440 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IVDP26440 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IVDP26440 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IVDP26440 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IVDP26440 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IVDP26440 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IVDP26440 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IVDP26440 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IVDP26440 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IVDP26440 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IVDP26440 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IVDP26440 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IVDP26440 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IVDP26440 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IVDP26440 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IVDP26440 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IVDP26440 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IVDP26440 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IVDP26440 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IVDP26440 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IVDP26440 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IVDP26440 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IVDP26440 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IVDP26440 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IVDP26440 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IVDP26440 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IVDP26440 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IVDP26440 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IVDP26440 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IVDP26440 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IVDP26440 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IVDP26440 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IVDP26440 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IVDP26440 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IVDP26440 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IVDP26440 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IVDP26440 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IVDP26440 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IVDP26440 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IVDP26440 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IVDP26440 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IVDP26440 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IVDP26440 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IVDP26440 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IVDP26440 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IVDP26440 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IVDP26440 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IVDP26440 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IVDP26440 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
IVDP26440 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IVDP26440 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IVDP26440 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IVDP26440 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IVDP26440 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IVDP26440 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IVDP26440 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
IVDP26440 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IVDP26440 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IVDP26440 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IVDP26440 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IVDP26440 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IVDP26440 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IVDP26440 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms