Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGA3P26006 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms