Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NFKBIAP25963 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms