Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCHP24723 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms