Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCND1P24385 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCND1P24385 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCND1P24385 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCND1P24385 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCND1P24385 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCND1P24385 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCND1P24385 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCND1P24385 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCND1P24385 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCND1P24385 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCND1P24385 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND1P24385 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND1P24385 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND1P24385 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND1P24385 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND1P24385 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND1P24385 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND1P24385 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND1P24385 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND1P24385 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND1P24385 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND1P24385 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND1P24385 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND1P24385 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND1P24385 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND1P24385 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND1P24385 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND1P24385 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND1P24385 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND1P24385 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCND1P24385 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCND1P24385 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCND1P24385 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCND1P24385 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCND1P24385 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCND1P24385 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCND1P24385 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCND1P24385 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCND1P24385 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCND1P24385 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCND1P24385 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCND1P24385 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCND1P24385 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCND1P24385 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCND1P24385 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCND1P24385 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCND1P24385 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCND1P24385 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCND1P24385 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCND1P24385 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCND1P24385 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCND1P24385 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCND1P24385 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCND1P24385 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCND1P24385 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCND1P24385 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCND1P24385 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCND1P24385 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCND1P24385 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCND1P24385 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCND1P24385 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCND1P24385 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCND1P24385 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCND1P24385 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCND1P24385 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCND1P24385 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCND1P24385 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCND1P24385 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCND1P24385 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCND1P24385 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCND1P24385 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCND1P24385 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCND1P24385 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCND1P24385 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCND1P24385 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCND1P24385 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCND1P24385 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCND1P24385 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCND1P24385 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCND1P24385 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCND1P24385 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCND1P24385 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCND1P24385 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCND1P24385 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCND1P24385 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCND1P24385 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND1P24385 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND1P24385 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND1P24385 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND1P24385 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND1P24385 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND1P24385 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND1P24385 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND1P24385 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCND1P24385 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND1P24385 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND1P24385 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND1P24385 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND1P24385 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms