Protein–RNA interactions for Protein: P23560

BDNF, Brain-derived neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDNFP23560 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BDNFP23560 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BDNFP23560 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BDNFP23560 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BDNFP23560 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BDNFP23560 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BDNFP23560 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BDNFP23560 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BDNFP23560 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BDNFP23560 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BDNFP23560 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BDNFP23560 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BDNFP23560 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BDNFP23560 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BDNFP23560 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BDNFP23560 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BDNFP23560 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BDNFP23560 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BDNFP23560 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BDNFP23560 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BDNFP23560 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BDNFP23560 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BDNFP23560 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BDNFP23560 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BDNFP23560 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BDNFP23560 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BDNFP23560 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BDNFP23560 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BDNFP23560 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BDNFP23560 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BDNFP23560 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BDNFP23560 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BDNFP23560 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BDNFP23560 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BDNFP23560 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BDNFP23560 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BDNFP23560 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BDNFP23560 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BDNFP23560 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BDNFP23560 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BDNFP23560 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BDNFP23560 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BDNFP23560 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BDNFP23560 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BDNFP23560 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BDNFP23560 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BDNFP23560 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BDNFP23560 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BDNFP23560 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BDNFP23560 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BDNFP23560 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BDNFP23560 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BDNFP23560 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BDNFP23560 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BDNFP23560 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BDNFP23560 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BDNFP23560 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BDNFP23560 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BDNFP23560 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BDNFP23560 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BDNFP23560 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BDNFP23560 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BDNFP23560 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BDNFP23560 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BDNFP23560 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BDNFP23560 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BDNFP23560 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BDNFP23560 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BDNFP23560 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BDNFP23560 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BDNFP23560 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BDNFP23560 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BDNFP23560 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BDNFP23560 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BDNFP23560 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BDNFP23560 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BDNFP23560 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BDNFP23560 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BDNFP23560 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BDNFP23560 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BDNFP23560 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BDNFP23560 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BDNFP23560 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BDNFP23560 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BDNFP23560 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BDNFP23560 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BDNFP23560 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BDNFP23560 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BDNFP23560 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BDNFP23560 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BDNFP23560 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BDNFP23560 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BDNFP23560 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BDNFP23560 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BDNFP23560 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BDNFP23560 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BDNFP23560 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BDNFP23560 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BDNFP23560 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BDNFP23560 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms