Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYF6P23409 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYF6P23409 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYF6P23409 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYF6P23409 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYF6P23409 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYF6P23409 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYF6P23409 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYF6P23409 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYF6P23409 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYF6P23409 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MYF6P23409 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MYF6P23409 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MYF6P23409 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MYF6P23409 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MYF6P23409 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MYF6P23409 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MYF6P23409 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MYF6P23409 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MYF6P23409 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MYF6P23409 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MYF6P23409 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MYF6P23409 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MYF6P23409 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MYF6P23409 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MYF6P23409 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MYF6P23409 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MYF6P23409 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MYF6P23409 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MYF6P23409 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYF6P23409 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYF6P23409 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYF6P23409 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYF6P23409 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYF6P23409 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYF6P23409 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYF6P23409 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYF6P23409 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYF6P23409 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYF6P23409 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYF6P23409 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYF6P23409 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYF6P23409 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYF6P23409 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYF6P23409 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYF6P23409 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYF6P23409 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYF6P23409 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYF6P23409 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYF6P23409 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYF6P23409 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYF6P23409 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYF6P23409 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYF6P23409 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYF6P23409 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYF6P23409 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYF6P23409 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYF6P23409 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYF6P23409 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYF6P23409 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYF6P23409 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYF6P23409 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYF6P23409 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYF6P23409 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYF6P23409 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYF6P23409 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYF6P23409 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYF6P23409 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MYF6P23409 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYF6P23409 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MYF6P23409 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYF6P23409 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYF6P23409 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYF6P23409 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYF6P23409 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYF6P23409 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYF6P23409 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYF6P23409 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYF6P23409 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MYF6P23409 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYF6P23409 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYF6P23409 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYF6P23409 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MYF6P23409 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MYF6P23409 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MYF6P23409 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MYF6P23409 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYF6P23409 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYF6P23409 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYF6P23409 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MYF6P23409 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYF6P23409 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYF6P23409 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYF6P23409 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYF6P23409 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYF6P23409 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYF6P23409 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYF6P23409 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYF6P23409 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYF6P23409 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms