Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD247P20963 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD247P20963 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD247P20963 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD247P20963 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD247P20963 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD247P20963 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD247P20963 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD247P20963 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD247P20963 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD247P20963 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD247P20963 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD247P20963 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD247P20963 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD247P20963 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD247P20963 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD247P20963 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD247P20963 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD247P20963 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD247P20963 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD247P20963 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD247P20963 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD247P20963 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD247P20963 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD247P20963 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD247P20963 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD247P20963 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD247P20963 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CD247P20963 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD247P20963 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CD247P20963 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD247P20963 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD247P20963 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD247P20963 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD247P20963 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD247P20963 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD247P20963 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD247P20963 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD247P20963 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD247P20963 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD247P20963 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD247P20963 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD247P20963 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD247P20963 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD247P20963 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD247P20963 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD247P20963 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD247P20963 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD247P20963 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CD247P20963 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CD247P20963 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD247P20963 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD247P20963 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD247P20963 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD247P20963 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD247P20963 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD247P20963 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD247P20963 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD247P20963 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD247P20963 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CD247P20963 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CD247P20963 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD247P20963 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD247P20963 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD247P20963 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD247P20963 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD247P20963 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD247P20963 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD247P20963 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD247P20963 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD247P20963 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD247P20963 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD247P20963 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD247P20963 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD247P20963 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD247P20963 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD247P20963 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD247P20963 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD247P20963 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD247P20963 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD247P20963 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD247P20963 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD247P20963 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD247P20963 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD247P20963 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD247P20963 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD247P20963 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD247P20963 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD247P20963 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD247P20963 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD247P20963 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD247P20963 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD247P20963 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD247P20963 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD247P20963 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD247P20963 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD247P20963 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD247P20963 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD247P20963 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CD247P20963 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.2 ms