Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB4AP20338 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms