Protein–RNA interactions for Protein: P20336

RAB3A, Ras-related protein Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3AP20336 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3AP20336 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms