Protein–RNA interactions for Protein: P20061

TCN1, Transcobalamin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN1P20061 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCN1P20061 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TCN1P20061 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCN1P20061 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCN1P20061 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCN1P20061 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCN1P20061 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TCN1P20061 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCN1P20061 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCN1P20061 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCN1P20061 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCN1P20061 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCN1P20061 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCN1P20061 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCN1P20061 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCN1P20061 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCN1P20061 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCN1P20061 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCN1P20061 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCN1P20061 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCN1P20061 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCN1P20061 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCN1P20061 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCN1P20061 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCN1P20061 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCN1P20061 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCN1P20061 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCN1P20061 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCN1P20061 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCN1P20061 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCN1P20061 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TCN1P20061 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCN1P20061 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCN1P20061 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCN1P20061 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCN1P20061 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCN1P20061 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCN1P20061 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCN1P20061 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCN1P20061 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCN1P20061 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCN1P20061 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCN1P20061 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCN1P20061 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCN1P20061 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCN1P20061 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCN1P20061 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCN1P20061 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCN1P20061 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCN1P20061 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCN1P20061 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCN1P20061 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCN1P20061 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCN1P20061 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCN1P20061 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCN1P20061 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCN1P20061 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCN1P20061 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCN1P20061 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCN1P20061 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCN1P20061 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCN1P20061 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCN1P20061 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCN1P20061 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCN1P20061 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCN1P20061 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCN1P20061 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCN1P20061 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TCN1P20061 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCN1P20061 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCN1P20061 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCN1P20061 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TCN1P20061 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TCN1P20061 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TCN1P20061 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCN1P20061 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCN1P20061 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCN1P20061 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCN1P20061 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCN1P20061 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCN1P20061 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCN1P20061 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCN1P20061 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCN1P20061 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCN1P20061 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCN1P20061 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCN1P20061 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCN1P20061 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCN1P20061 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCN1P20061 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TCN1P20061 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCN1P20061 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCN1P20061 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCN1P20061 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCN1P20061 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCN1P20061 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCN1P20061 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCN1P20061 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCN1P20061 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCN1P20061 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms